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中國藥科大學人工智能藥物設計微專業(yè)招生簡章

江蘇南京 全部類型 2025年06月20日
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中國藥科大學人工智能藥物設計微專業(yè)招生簡章

一、 人工智能藥物設計微專業(yè)介紹

人工智能藥物設計微專業(yè)是為響應國家“十四五”生物經(jīng)濟發(fā)展規(guī)劃與新一代人工智能發(fā)展戰(zhàn)略,并針對全球創(chuàng)新藥研發(fā)智能化轉型需求而設立的跨學科前沿培養(yǎng)項目。近年來,深度學習、機器學習等人工智能(Artificial Intelligence, AI)技術不斷取得突破,傳統(tǒng)的藥物研發(fā)模式已難以滿足需求,急需新的技術和方法來提高研發(fā)效率,降低研發(fā)成本,提升成功率,這為人工智能藥物設計的發(fā)展提供了內(nèi)在動力。人工智能藥物設計是近年來新藥研究的熱點方向,被應用到藥物研發(fā)的各個階段。這種技術革新催生了藥學領域對復合型人才的迫切需求。

人工智能藥物設計是以人工智能技術為核心,深度融合計算生物學與藥物化學的交叉學科。在生物醫(yī)藥領域迎來技術革新的當下,AI正成為突破傳統(tǒng)研發(fā)瓶頸的核心驅動力。本專業(yè)的學習將聚焦如何利用AI工具解決新藥研發(fā)中的技術難題,學生將系統(tǒng)學習多種AI工具的使用方法,掌握從靶點發(fā)現(xiàn)到候選化合物設計的全流程應用場景。

二、 主辦單位與共建單位

主辦單位:點擊登錄查看

共建單位:上海大學;深勢科技;晶泰科技

三、 招生對象和計劃

招生對象:藥學、藥物化學等涉及藥物設計專業(yè)的學生

年度招生計劃:30人

四、 課程設置

課程名稱

開課學院

學分

學時

學期

總分

理論

實踐

理論

實踐

藥物研究與開發(fā)基礎

藥學院

2

2

0

34

0

4

化學生物學

藥學院

2

2

0

34

0

4

人工智能藥物設計(校企共建)

藥學院

3

3

0

51

0

5

人工智能藥物設計實驗

藥學院

3

2

1

34

34

5

新藥研發(fā)綜合實戰(zhàn)(校企共建)

藥學院,現(xiàn)代制藥產(chǎn)業(yè)學院

3

2

1

34

34

6

總學分

13

11

2

187

68

1.《藥物研究與開發(fā)基礎》課程簡介

《藥物研究與開發(fā)基礎》課程聚焦藥物研發(fā)基本原理與方法,助力藥學和AI知識融合。內(nèi)容以藥物化學為核心,融合藥物設計、成藥性優(yōu)化與評價、計算機輔助藥物設計、藥物合成反應等課程要點。借助藥物研發(fā)案例,著重傳授現(xiàn)代藥物研發(fā)關鍵思路與方法,從藥物設計的理論,到合成反應的實踐,再到成藥性評估等環(huán)節(jié),構建起藥物研發(fā)知識體系,為學生搭建從基礎原理到實際應用的橋梁,推動對藥物研發(fā)全流程的科學認知,適配藥學領域結合AI等新技術發(fā)展的需求。

2.《化學生物學》課程簡介

《化學生物學》課程從分子層面解析生命現(xiàn)象,聚焦生物大分子化學性質及相互作用,為后續(xù)研究藥物作用機制、疾病診斷等知識的學習筑牢理論根基。課程介紹化學探針設計、熒光標記等化學生物學前沿研究手段;融入“AI+”內(nèi)容,講解AlphaFold系列工具、深度學習神經(jīng)網(wǎng)絡算法對化學生物學發(fā)展的推動作用。該課程教授化學工具在生物體系中的應用并且緊密關聯(lián)醫(yī)學問題,助力學生掌握從基礎研究到臨床轉化的全鏈條思維,推動診斷工具、新型療法及精準醫(yī)療方案的創(chuàng)新,適配化學生物學交叉學科發(fā)展需求,為深入探索生命科學奧秘與醫(yī)藥研究奠定基礎。

3.《人工智能藥物設計(校企共建)》課程簡介

《人工智能藥物設計(校企共建)》課程將深入講解AI技術用于藥物分子設計的過程與思路,讓學生掌握AI基礎理論和應用場景,培養(yǎng)用AI解決研發(fā)難題的思維能力。課程內(nèi)容覆蓋了深度學習、分子模擬、藥物性質及劑型預測等重要方面,結合領域內(nèi)的最新研究成果和實際案例幫助學生深入理解如何將AI技術應用于新藥研發(fā),旨在培養(yǎng)學生運用這些工具進行藥物開發(fā)與優(yōu)化的能力。同時通過實踐教學使學生掌握AI制藥軟件的操作,積累實踐經(jīng)驗,使學生更好地理解如何利用這些工具進行藥物設計與優(yōu)化,為日后的科研工作打下堅實的基礎。

4.《人工智能藥物設計實驗》課程簡介

《人工智能藥物設計實驗》課程通過基礎技術與算法實踐,讓學生掌握從數(shù)據(jù)預處理到模型生成等AI輔助藥物設計工具的應用方法,筑牢從數(shù)據(jù)輸入到分子生成的系統(tǒng)性知識基礎。教學圍繞AI輔助藥物設計工具練習展開,涵蓋靶點發(fā)現(xiàn)平臺PandaOmics,蛋白質結構預測工具AlphaFold3,以及開源生成式AI框架REINVENT4。學生通過實驗可以掌握主流工具(如RDKit、DeepChem、AutoDock)的使用,學習化合物庫構建、虛擬篩選流程及活性預測方法。這些工具覆蓋藥物研發(fā)關鍵環(huán)節(jié),幫助學生將AI理論轉化為實踐技能,適配AI與藥物研發(fā)交叉領域對實操人才的需求。

5.《新藥研發(fā)綜合實戰(zhàn)(校企共建)》課程簡介

《新藥研發(fā)綜合實戰(zhàn)(校企共建)》課程采取雙導師制教學模式,以真實藥物研發(fā)案例為導向,以實際參與AIDD藥物研發(fā)為目標,對藥學與AI進行綜合實踐。課程以企業(yè)級AI藥物研發(fā)平臺為核心,講授數(shù)據(jù)預處理、分子生成模型開發(fā)及虛擬篩選流程;從靶點結構解析→AI生成分子→合成路線預測→體外活性驗證,全程模擬企業(yè)研發(fā)管線。藥企科學家參與教學,傳授工業(yè)界經(jīng)驗(如專利規(guī)避策略、CMC(化學制造與控制)早期評估);分組扮演計算化學家、合成化學家、生物學家角色,使用企業(yè)級協(xié)作工具(如電子實驗記錄本ELN)推進項目。撰寫符合藥企標準的研發(fā)報告,包括IND(新藥臨床申請)申報材料框架與AI模型驗證文檔,銜接行業(yè)實際需求。

五. 師資團隊

專業(yè)負責人

孫昊鵬,點擊登錄查看,藥物化學系主任,教授,博士生導師,中國藥科大學藥物化學博士(碩博連讀)畢業(yè),美國明尼蘇達大學訪問學者,主要針對神經(jīng)退行性疾病、中樞腫瘤、代謝紊亂相關疾病開展生物活性分子的發(fā)現(xiàn)及優(yōu)化研究。已在J. Med. Chem., Acta Pharm. Sin. B, Angew. Chem. Int. Edit., Med. Res. Rev. 等期刊發(fā)表SCI論文180余篇,其中以通訊作者發(fā)表藥物化學頂尖期刊J. Med. Chem.19篇,總引用5100次,H-index 38。獲得國家發(fā)明專利授權24項。已實現(xiàn)3項專利技術的企業(yè)轉化。入選國家“萬人計劃” 青年拔尖人才、江蘇省 “333高層次人才培養(yǎng)工程” 、 “青藍工程” 優(yōu)秀青年骨干教師,獲中國藥學會-施維雅青年藥物化學獎。主持或參與國家自然科學基金、江蘇省自然科學基金、教育部及江蘇省工程中心建設等項目十余項。課題組學生多次研究生國家獎學金、校長獎學金、優(yōu)秀學位論文重點培育和各級獎學金。

徐云根,點擊登錄查看,二級教授,博士生導師,江蘇省藥物設計與成藥性優(yōu)化重點實驗室副主任,中國藥科大學學術委員會委員;江蘇省第六屆十大杰出專利發(fā)明人,江蘇省高?!扒嗨{工程”中青年學術帶頭人。兼任中國藥學會藥物化學專業(yè)委員會委員,全國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè)企業(yè)管理協(xié)會精準醫(yī)療分會理事,國家執(zhí)業(yè)藥師資格考試命審題專家,江蘇省藥學會藥物化學專業(yè)委員會副主任委員。擔任《中國藥科大學學報》、《中國藥物化學雜志》《中國現(xiàn)代應用藥學》等期刊編委。近年來,先后主持完成國家“重大新藥創(chuàng)制”科技重大專項,國家自然科學基金等國家級科研項目10余項;主持重大成果轉化項目3項目。近三年到賬經(jīng)費超過1000萬元。獲得國內(nèi)外授權發(fā)明專利60余件,其中有權發(fā)明專利50余件;2個候選新藥實現(xiàn)成果轉讓;多項專利技術或產(chǎn)品實施產(chǎn)業(yè)化,經(jīng)濟效益顯著。發(fā)表SCI論文120余篇。獲得江蘇省教育研究成果獎一等獎1項(1/5)。編寫出版《藥物化學》、《藥物設計學》等教材和專著10余本。

校內(nèi)團隊成員

江程,點擊登錄查看,教授,博士生導師,中國藥科大學教務處副處長。江蘇省教學名師,江蘇省“青藍工程”中青年學術帶頭人,中華醫(yī)學會醫(yī)學教育分會青年委員,江蘇省高等學校醫(yī)藥教育研究會理事,江蘇省工程訓練教學研究會理事,江蘇省藥物研究與開發(fā)協(xié)會會員,江蘇省藥品注冊現(xiàn)場核查專家。作為專業(yè)負責人獲批“藥物化學”省產(chǎn)教融合品牌專業(yè)建設點,主持省教改課題重點項目2項,參與多項省部級教研教改課題,主編《藥學綜合實驗與指導》《藥學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)基礎與實踐》教材、藥學科普《改變世界的藥物》,參編人民衛(wèi)生出版社《藥物化學》(第9版)等教材6部,作為核心成員獲“藥物化學”線上課程和線下課程2項國家級一流課程,獲全國藥學類青年教師微課比賽特等獎、江蘇省教學創(chuàng)新比賽二等獎等獎項,指導學生獲中國國際大學生創(chuàng)新大賽國家級金獎等多項獎項。主要從事新藥設計與合成研究、多肽藥物研究,禁毒關鍵技術研究,以及藥學教學與改革研究,主持國家自然科學基金四項、江蘇省自然科學基金一項。在J Med Chem,Eur J Med Chem等期刊發(fā)表發(fā)表高水平論文50余篇,授權國家發(fā)明專利5件。

李玉艷,點擊登錄查看,教授,點擊登錄查看博士畢業(yè),麻省總醫(yī)院/哈佛醫(yī)學院、影像學系訪問學者,研究方向為新藥分子設計與合成,藥物合成工藝革新和產(chǎn)業(yè)化。目前,在阿爾茨海默病和腫瘤的早期診斷探針,干擾腫瘤蛋白-蛋白相互作用等領域展開工作。主持國家自然科學基金1項,江蘇省自然科學基金2項,江蘇省產(chǎn)學研前瞻性項目1項,企業(yè)合作項目1項;參與國家自然科學基金重點項目,國家自然科學基金,國家重大新藥創(chuàng)制科技重大專項等多項;在Chemical Science,Green Chem.,Chem.Comm.,European Journal of Medicinal Chemistry等期刊發(fā)表論文12篇;授權專利5個。工作在教學科研一線,獲得江蘇省高校微課教學比賽一等獎 國家優(yōu)秀獎 (2015) ,國家科學技術進步二等獎(第7,2016)。

褚錢,點擊登錄查看,江蘇特聘教授,博士生導師。2001年至2008年在南京大學化學化工學院完成本科和碩士學習。2014年博士畢業(yè)于美國哈佛大學化學與化學生物學系,主要從事以藥物研發(fā)為導向的多肽分子的設計、合成以及相關化學生物學和藥物化學研究。2014年至2020年在美國索爾克生物研究所開展博士后研究,主要從事新型微蛋白的發(fā)現(xiàn)和生物功能表征。2020年9月加入點擊登錄查看開展獨立科研工作,主持國家自然科學基金面上項目等多項科研項目,迄今已在Nat. Chem. Biol., Nat. Commun.和J. Am. Chem. Soc.等國際重要科學期刊發(fā)表論文多篇。

王磊,點擊登錄查看,特聘研究員,博士生導師。獲得江蘇省優(yōu)秀青年基金(2023),中國藥科大學興藥青創(chuàng)學者(2023),中國科協(xié)青年人才托舉工程(2021),江蘇省科創(chuàng)U35創(chuàng)新獎(2022)等。擔任南京藥學會藥物化學專委會委員、《藥學學報》中英雙刊青年編委、《中國藥科大學學報》、《中國藥學雜志》等期刊的青年編委。研究方向:蛋白成熟與翻譯后修飾的化學干預,具體包括(1)靶向分子伴侶系統(tǒng)的小分子藥物設計;(2)磷酸酶系統(tǒng)小分子調(diào)控劑設計;(3)多特異性分子的設計與化學生物學研究。正在主持國家自然科學基金面上項目等國家/省部級課題十余項。近年來基于分子伴侶系統(tǒng)蛋白識別位點,結合藥物化學與化學生物學手段,設計并發(fā)現(xiàn)了多個具有全新作用機制的分子伴侶系統(tǒng)小分子調(diào)控劑。近五年以第一/通訊作者在 J.Am.Chem.Soc, Sci.Adv, J.Med.Chem(7篇), Med.Res.Rev, Acta.Pharm.Sin.B 等學術期刊發(fā)表論文三十余篇,獲授權專利5項。研究聚焦小分子藥物設計,連續(xù)5年受邀在《藥學學報》專家論壇板塊評述當年全球新藥研發(fā)進展。

鄒毅,點擊登錄查看,副教授,2017年畢業(yè)于中國藥科大學新藥研究中心,獲得藥物化學博士學位。2017-2020年在中國科學院上海藥物研究所從事博士后研究工作,期間主要開展基于結構的抗炎小分子設計。2020年7月進入點擊登錄查看藥物化學系工作,主要研究方向為計算化學驅動的藥物分子設計、調(diào)節(jié)機體免疫的小分子藥物發(fā)現(xiàn)。作為課題負責人主持中國博士后面上基金一等資助1項(2018M630485)、國家自然科學基金青年項目1項(****)、江蘇省自然科學基金面上項目1項(BK****)和中央高?;究蒲袠I(yè)務專項基金重點項目1項(****ZD14)。作為骨干成員參與多項國家自然科學基金項目3項及2022年度“雙一流”建設項目前瞻基礎研究專項1項。以第一或通訊作者發(fā)表SCI研究性論文10余篇,授權專利3項。承擔的教學工作包括本科生《計算機輔助藥物設計》、《藥物化學實驗》和《藥物合成反應實驗》課程;碩士研究生《計算機輔助藥物設計基礎》、《計算機技術在新藥研發(fā)中的應用》和《新藥設計與合成》課程;博士研究生《藥物分子設計》及《藥物設計與新藥研究》課程。

校外團隊成員

卞月珉,上海大學醫(yī)學院,特聘教授,博士生導師,國家級高層次青年人才,上海市海外高層次人才。本科畢業(yè)于中國藥科大學(2011-2015),博士畢業(yè)于美國匹茲堡大學(2015-2020),博士畢業(yè)后擔任資深計算科學家,就職于美國麻省理工和哈佛大學布羅德研究所從事人工智能新藥研發(fā)工作(2021-2024),2024年3月回國全職加入上海大學。長期致力于人工智能藥物發(fā)現(xiàn)相關研究,通過開發(fā)并整合機器學習與深度學習算法,計算化學與計算生物學策略手段,加速臨床前早期藥物發(fā)現(xiàn)。近五年,發(fā)表包括Nature、Cell在內(nèi)的通訊/第一/共一SCI論文及專著16篇,H因子12,累計影響因子超過196。主持國家級高層次海外人才基金項目、上海市高層次海外人才基金項目等國家級、省部級項目4項。擔任英國國家研究與創(chuàng)新署UKRI、智利國家研究與發(fā)展署ANID基金評審外籍專家,BMC Pharmacology and Toxicology雜志客座編輯,Nature Communications、Briefings in Bioinformatics等雜志審稿人。

六.學制學分與結業(yè)注意事項

學制:2年

學分:13學分

結業(yè)注意事項:學生在培養(yǎng)方案規(guī)定的學習年限內(nèi),完成微專業(yè)培養(yǎng)方案規(guī)定課程的修讀,成績合格,達到最低畢業(yè)要求學分,經(jīng)學院審核后,報教務處審定,由教務處負責統(tǒng)一頒發(fā)“人工智能藥物設計”微專業(yè)證書,學生可向學校申請微專業(yè)課程成績單;本微專業(yè)不授予學位。

七.報名、選拔方式

報名方式:申請修讀微專業(yè)學生需慎重思考,將以下材料按照順序掃描為一個PDF,命名為人工智能藥物設計微專業(yè)申請表+學院+姓名.pdf,于****17:00之前發(fā)送至****@cpu.edu.cn。

1.人工智能藥物設計微專業(yè)申請表(模板見附件);

2.必修課程成績單(標明平均學分績點);

3.與人工智能藥物設計微專業(yè)相關的實踐成果(如競賽獲獎、文章發(fā)表、專利申請、科研項目參與證明等);

4.其他材料(按需提交)。

選拔要求:初審+筆試

選拔程序:

1.報名

(1)學生須在規(guī)定時間內(nèi)完成報名。

(2)材料提交:填寫申請表并附成績單、實踐成果等材料。

2.初審階段

根據(jù)GPA、先修課程完成情況篩選,淘汰未達基本門檻者。

3.考核與錄取

(1)根據(jù)報名順序,結合總分排名,擇優(yōu)錄取。

(2)結果公示:選拔結果于考核結束后5個工作日內(nèi)公示,接受申訴與復核。

(3)補錄機制:若錄取學生放棄資格,按總分排名依次遞補。

學生自愿報名,經(jīng)各微專業(yè)主辦學院選拔,確定學生錄取名單后報教務處備案。

八.注意事項

學生在申請報名微專業(yè)前,應充分評估自身學習情況,充分了解微專業(yè)實施管理辦法及專業(yè)課程設置。每位學生在同一年度只能報名申請修讀一個微專業(yè),前一個微專業(yè)修讀完畢后方可提出下一個微專業(yè)修讀申請。

九.聯(lián)系方式

聯(lián)系人:****g@cpu.edu.cn

聯(lián)系電話:****

聯(lián)系郵箱:****g@cpu.edu.cn

未盡事宜由微專業(yè)主辦單位負責解釋。

附件:中國藥科大學人工智能藥物設計微專業(yè)申請表.docx

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